GO的主要用途之一是对基因组进行富集分析。例如，给定一组在特定条件下上调的基因，富集分析将使用该基因组的注释发现哪些GO术语被过度表示（或未充分表示）。　　富集分析工具             　  用户可以直接从GOC网站的主页进行浓

pathviewR包是一个集成pathway通路数据与可视化的工具集。它用于把用户的数据映射并渲染到相关的pathway通路图上，用户只需要提供基因或者化合物数据（geneorcompounddata）并指定目标通路（specifythetargetpathway）即可。pathview会产生nativeKEGGv

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欢迎关注”生信修炼手册”!HiC技术的出现和发展掀起了三维基因组学研究的浪潮，该技术通量高，一次建库即可在全基因组范围内研究染色质三维空间结构，已经染色体空间互作关系，有助于更深层次地挖掘和了解基因的调控关系，本文整理了HiC数据分析相关的资料。首先是该领域的一些基本概念chromosometerr

生信论文的套路1.ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析；2.临床标本从蛋白水平确认（或HPA数据库），很重要；3.KaplanMeierPlotter从临床意义的角度阐明其重要性；4.cBioportal数据库做基因组学的分析（机制一）；5.STRING互作和

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Requests唯一的一个非转基因的PythonHTTP库，人类可以安全享用。警告：非专业使用其他HTTP库会导致危险的副作用，包括：安全缺陷症、冗余代码症、重新发明轮子症、啃文档症、抑郁、头疼、甚至死亡。1环境准备：新建Python3.x虚拟环境mkvirtualenvPy3_

欢迎关注”生信修炼手册”!CNV全称为CopyNumberVariatiosn,即拷贝数异常，是广泛存在于基因组上的一种结构变异现象。异常片段大小从1Kb到数Mb范围不等,包括了拷贝数的缺失、插入、重组以及多位点的复杂变异等多种情况。作为结构变异的一种，科学家自然而然将CNV和疾病联系起来，有很多的研究表明了CNV和疾病的关联性

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作者：佳名来源：简书R语言文集1\.读取并处理基因表达数据这是我的基因表达量数据：!(https://oscimg.oschina.net/oscnet/505049817d7347a7acffef1befd7f67d.png"图Fig1

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功能富集泡泡图功能富集分析用来展示某一组基因(一般是单个样品上调或下调的基因)倾向参与哪些功能调控通路，对从整体理解变化了的基因的功能和潜在的调控意义具有指导作用，也是文章发表中一个有意义的美图。通常会用柱状图、泡泡图和热图进行展示。热图的画法之前已经介绍过，这次介绍下富集分析泡泡图,其展示的信息是最为全面的，也是比较抓人眼球的。做基因功能富集分

商米科技成立于2013年，总部位于上海市杨浦区创智天地，是一家极具产品创新基因和互联网基因的公司。商米在短时间内迅速成长为一家近1000人的企业，产品研发人数占比一度超过70%。做为一家初创企业，商米研发团队早期也经历过与当下大部分创业公司一样困境：协作基本靠吼、发布基本靠手的阶段。然而，业务的快速发展，团队规模不断的扩大，给商米带来了在「团队协作」

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参考：生信技能树ChIPSeq综述(https://www.oschina.net/action/GoToLink?urlhttps%3A%2F%2Fwww.plob.org%2Farticle%2F3760.html)一些简单的copy，纯属个人笔记。 ChIPseq的原理用于在全基因组范围中研究DNA结合

随着大数据、人工智能和高性能计算的迅猛发展，在大数据分析、基因测序、芯片设计、数据库和AI训练等“大计算”应用场景中，计算资源需求呈现爆发式增长态势，而传统的计算架构在资源利用率、扩展性、IO性能等方面存在诸多挑战。

大家好，我是皮皮。一、前言前几天在Python铂金交流群【红色基因代代传】问了一个Pandas处理的问题，提问截图如下：!(https://uploadimages.jianshu.io/upload_images/2623978

是一款强大的分子生物学软件，专为Mac操作系统设计。它主要用于帮助科研人员快速绘制DNA序列、基因组结构和其他生物分子的结构，适用于在科学实验室、生物技术公司和医学研究机构等领域使用。SnapGene5forMac具有以下主要功能和特点：DNA序列绘制：S